Migración de bromuro de etidio a GelRed en la tinción de ácidos nucleicos en gel de agarosa

Autores/as

  • Oscar Arbizú Medina Docente titular UNAN-Managua/ Responsable de Laboratorio de Biología Molecular “MA. Elmer Cisneros in memoriam”, Instituto Politécnico de la Salud, Universidad Nacional Autónoma de Nicaragua, Managua, UNAN-Managua https://orcid.org/0000-0002-5984-8298
  • Francisco Romero Oviedo Docente investigador Laboratorio de Biología Molecular “MA. Elmer Cisneros in memoriam”, Instituto Politécnico de la Salud, Universidad Nacional Autónoma de Nicaragua, Managua, UNAN-Managua https://orcid.org/0000-0001-6161-7539
  • Yosimar Narváez González Investigador Laboratorio de Biología Molecular “MA. Elmer Cisneros in memoriam”, Instituto Politécnico de la Salud, Universidad Nacional Autónoma de Nicaragua, Managua, UNAN-Managua https://orcid.org/0000-0002-8239-3885
  • Roshell Rizo Obregón Investigador Laboratorio de Biología Molecular “MA. Elmer Cisneros in memoriam”, Instituto Politécnico de la Salud, Universidad Nacional Autónoma de Nicaragua, Managua, UNAN-Managua https://orcid.org/0000-0002-3843-1346

DOI:

https://doi.org/10.5377/rtu.v13i38.19325

Palabras clave:

ADN bacteriano, electroforesis, mutagénicos, biología molecular

Resumen

El bromuro de etidio (EtBr) es un colorante fluorescente ampliamente utilizado para la tinción de ácidos nucleicos en geles de agarosa y poliacrilamida. No obstante, el EtBr presenta varios incovenientes, como su alta toxicidad y capacidad mutagénica, lo que restringe su uso y manejo. En este estudio, se evaluó el uso de GelRed®, un colorante alternativo desarrollado por Biotium, que ofrece una mayor sensibilidad, seguridad y estabilidad que el EtBr. Se comparó el rendimiento de ambos colorantes para la tinción de ADN amplificado por PCR, utilizando los protocolos de BCR-ABL, JACK2, BLEE, Carbapenemasas IMP, VIM, SPM, GIM, NDM, KPC, OXA, mcr-1/mcr-2 y mecA.
Los resultados indicaron que el GelRed® puede ser utilizado para visualizar el ADN con una intensidad de fluorescencia igual o mayor que la del EtBr, sin necesidad de modificar los protocolos de extracción, amplificación y electroforesis. Además, GelRed® no interfirió con las enzimas de restricción y la PCR, y no presenta efectos mutagénicos o citotóxicos. Se llega a la conclusión de que el GelRed® es una opción segura y sensible en comparación con el EtBr para la tinción de ácidos nucleicos en geles de agarosa.

Descargas

Los datos de descargas todavía no están disponibles.

Citas

Arbizú Medina, O., Romero Oviedo, F., García Rosales, K., Molina Morales, A. E., García Herrera, F. A., Centeno Rizo, B. R., . . . Amaya, E. (2023). cinetobacter baumannii, multiresistentes a los carbapenémicos a nivel hospitalario. 12(23). doi:DOI: https://doi.org/10.5377/rtu.v12i33.15895.

Hall, A. (2019). A comparison of DNA stains and staining methods for Agarose Gel Electrophoresis. bioRxiv, doi: 10.1101/568253.

Ude, A., Afi-Leslie, K., Okeke, K., & Ogbodo, E. (2022). Trypan Blue Exclusion Assay, Neutral Red, Acridine Orange and Propidium Iodide. In Cytotoxicity. IntechOpen.

Masciotti, V. (2018). Design of an environment-indipendent, tunable 3D DNA-origami plasmonic sensor.

Debroy, A., Yadav, M., Dhawan, R., Dey, S., & George, N. (2022). DNA dyes: toxicity, remediation strategies and alternatives. Folia Microbiologica, 67(4), 555-571.

Haines, A. M., Tobe, S. S., Kobus, H. J., & Linacre, A. (2015). Effect of nucleic acid binding dyes on DNA extraction, amplification, and STR typing. Electrophoresis, 36(20), 2561-2568.

Vílchez, G., & Alonso, G. (2009). Alcances y limitaciones de los métodos de epidemiología molecular basados en el análisis de ácidos nucleicos. Revista de la Sociedad Venezolana de microbiología, 29(1), 6-12.

Publicado

28-11-2024

Cómo citar

Arbizú Medina , O., Romero Oviedo, F., Narváez González, Y., & Rizo Obregón, R. (2024). Migración de bromuro de etidio a GelRed en la tinción de ácidos nucleicos en gel de agarosa. Revista Torreón Universitario, 13(38), 145–150. https://doi.org/10.5377/rtu.v13i38.19325

Número

Sección

Ciencias

Artículos más leídos del mismo autor/a

Artículos similares

1 2 3 4 > >> 

También puede {advancedSearchLink} para este artículo.